消化道穿孔的X線腹部平片是最重要的檢查手段之一,多數胃腸道穿孔可以發現隔下的游離氣體,少數膽道創口也可以出現膈肌下游離氣體。部分胃腸道穿孔,尤其是小腸穿孔,因為局部黏連或者穿孔較小可以出現局部氣體彌散影,或者腹部不出現氣體影,如果是胃后壁或者十二指腸后壁穿孔,可出現腹膜后或者角膜將氣體影。
還有些其他檢查,如B超和CT檢查,它們可以檢查有沒有同時存在腹腔積液,有沒有美克憩室、腸重復畸形、腸道疊、化膿性闌尾炎、腹腔膿腫、膽總管囊腫等,對確定有無并發癥以及腸道穿孔的原因具有重要的意義。另外,還包括一些血的實驗室檢查,包括血常規、生化常規,用來判斷患兒的全身情況以及是否存在全身感染。