國內外專家的研究證實,部分的肝膽管癌是發生在肝膽管結石的基礎上的,這些病人常常是有十年以上的膽道病史,通過對肝膽管結石切除的肝葉標本的觀察,發現肝內膽管結石的長期的炎癥刺激和聚發感染,造成膽管粘膜糜爛或者是潰瘍,引起膽管上皮的再生,增殖。
少數導致發生表現為膽管上皮細胞分化功能開始紊亂,上皮細胞可以表現為乳頭狀的或者是腺瘤樣的增生,這些不典型的增生有可能是膽管癌的前期病變,在肝內膽管結石引起膽管癌的病例,也可以發現這種不典型的癥狀,有的有移行現象,因此這些研究就表明長期的肝膽管結石有可能是導致肝膽管癌的改變。