肺結核的診斷,主要是根據臨床癥狀、胸部x線表現以及痰結核分枝桿菌檢查,痰結核分枝桿菌檢查是確診的依據,但是涂片陽性率比較低,傳統的羅氏培養法比較費時,需要三個月左右,痰結核分枝桿菌基因檢測可以提高陽性率,并能縮短時間,但是昂貴的儀器專利化的培養基限制了它的廣泛應用。
其它的各種不含核素的液體培養基也有不少的報道,分子生物學診斷技術包括,定量的PCR、生物探針、芯片技術、噬菌體生物擴增技術,均是目前研究的關注熱點,纖支鏡檢查以及經過纖支鏡吸取分泌物,抓緊活檢可以提高病原菌的檢出率,還可能提供組織學的證據,也是目前應用的熱點。