甲硝唑主要用于治療或者預(yù)防厭氧菌引起的系統(tǒng)或者是局部的感染，如腹腔，消化道，女性生殖系，下呼吸道，皮膚及軟組織，骨和關(guān)節(jié)等部位的厭氧菌感染，對(duì)于敗血癥，心內(nèi)膜炎，腦膜感染以及使用抗生素引起的結(jié)腸炎也有效。
治療破傷風(fēng)，常與破傷風(fēng)抗毒素（簡(jiǎn)稱tat）聯(lián)用，還可以用于口腔厭氧菌的感染。由于劑型和規(guī)格的不同，用法用量應(yīng)該仔細(xì)閱讀藥品說(shuō)明書，或者是遵醫(yī)囑，片劑的一般是每片0.2克，注射液有5毫克，100毫克，500毫克，1.25克，500毫克，劑型不同，使用方法當(dāng)然也不同。
不良反應(yīng)是以消化道反應(yīng)最為多見，包括惡心，嘔吐，食欲不振，腹部絞痛等，一般不影響治療。神經(jīng)系統(tǒng)癥狀有頭疼，眩暈，偶有感覺異常，肢體麻木，共濟(jì)失調(diào)，多發(fā)性神經(jīng)炎等。
大劑量的話可以導(dǎo)致抽搐，少數(shù)病例發(fā)生蕁麻疹，潮紅，瘙癢，膀胱炎，排尿困難等，這些不良反應(yīng)均屬于可逆性，停藥后可以自行恢復(fù)。有活動(dòng)性的中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾患和血液病者禁用，妊娠期婦女及哺乳期婦女禁用。
