內分泌系統在更年期的變化比較顯著,其中最重要的是性腺,男性最大的性腺器官就是睪丸。睪丸組織自三十到五十歲以后就逐漸有退行性改變,表現為曲細精管基地膜增厚,部分曲細精管閉塞透明樣變,精子數量減少等。
但產生雄激素的間質細胞則位于曲精細管之外,其變化不完全與曲精細管改變同步,功能衰退較女性緩慢。睪酮的分泌盡管有所下降但比較平緩,從而使性腺與橋下丘腦垂體之間的關系有較為充分的重新調整機會。
所以男性更年期,因性腺與內分泌功能失調,致嚴重癥狀者較少。此外人到中年后期甲狀腺、腎上腺以及胰島、胸腺等內分泌功能也都有不同程度的改變。