克羅恩目前尚無特殊治療方法。無并發癥時,支持療法和對癥治療,可緩解有關癥狀。活動期宜臥床休息,高營養、低渣飲食。嚴重病例宜暫禁食,糾正水、電解質、酸堿平衡紊亂,采用腸內或腸外營養支持。貧血者可補充維生素B12、葉酸或輸血。
低蛋白血癥可輸白蛋白或血漿。水楊酸,柳氮磺胺吡啶、腎上腺皮質激素或6-巰基嘌呤等藥控制活動期癥狀有效。解痙、止痛、止瀉和控制繼發感染等也有助于癥狀緩解。補充多種維生素、礦物質促進體內酶類和蛋白質的合成,同時具有保護細胞膜作用。
藥物治療主要采用水楊酸類、腎上腺皮質激素,其他藥物對腎上腺皮質激素或磺胺藥治療無效者,可改用或加用硫唑嘌呤、6-巰嘌呤、環孢素、FK506等其他免疫抑制劑,也可合用左旋咪唑、干擾素、轉移因子、卡介苗及免疫球蛋白等免疫增強劑。此外,甲硝唑、廣譜抗生素和單克隆抗體等也可應用。手術治療用于完全性腸梗阻、腸瘺與膿腫形成、急性穿孔或不能控制的大出血,以及難以排除癌腫的患者。