病毒性腦炎經過正規治療康復以后一般不會再次復發。病毒性腦炎如果按照療程正規的治療以后,患者的頭痛、發熱、惡心、嘔吐、頸強直等癥狀均已經消失,并且腦電圖的結果也表現正常。經過腰椎穿刺化驗腦脊液,腦脊液的各項指標也沒有異常認為疾病已經被治愈,一般不會再次復發。
如果再次感染病毒,并且病毒的毒力比較強,而人的抵抗力比較弱的時候,可能會再次患有腦炎,但是這種情況并不屬于復發,而屬于新發。
容易反復出現病毒性腦炎的人多見于免疫功能有缺陷的。如艾滋病患者或者長期服用免疫抑制劑的患者,例如一些結締組織病或者臟器移植以后的患者,需要長期服用免疫制劑,上述這些病人容易出現反復的病毒性腦炎。