對于大多數患者,自身免疫性胰腺炎應用糖皮質激素治療是有效的,常用潑尼松治療,可以選擇0.6毫克每公斤體重每天作為提示劑量,持續1到2個月以后,根據治療反應酌情減量,以后每2到4周減少5毫克,維持劑量是2.5到5毫克每天,維持治療時間可以根據疾病活動程度,以及激素相關不良反應等情況來選擇。
一般是維持1到3年的時間,部分自身免疫性胰腺炎的患者,激素減量或者停用以后可以復發,但是再次應用仍是有效的治療,治療以后自身免疫性胰腺炎的影像學表現,最早在用藥2到4周后可以得到改善,腫大的胰腺會縮小,主胰管有不規則的狹窄也會消失,臨床癥狀也有相應的改善。