特發性間質性肺病的鑒別診斷有易引起繼發性肺間質纖維化的結締組織病、肺泡蛋白沉積癥、某些結節病和慢性外源性過敏肺泡炎、某些藥物性間質性肺纖維化等。
特發性間質性肺病應首先與易引起繼發性肺間質纖維化的結締組織病鑒別,比如存在嚴重的類風濕性關節炎、硬皮病、干燥綜合征等,這些結締組織病均有明顯的肺外臟器損害,以及不同的血液生化異常和自身免疫抗體反應陽性,故診斷并不困難。
其次,可以從特征性的胸部CT進行鑒別,比如呈彌漫性肺部陰影的肺泡蛋白沉積癥,其發展迅速,可伴有發熱、咳嗽,以及進行性的呼吸困難,因為它有特征性的CT表現,比如CT會出現地圖征,可以與其他類型的間質性肺病進行鑒別。
還有些呈彌漫性病變的晚期結節病和慢性外源性過敏肺泡炎,其胸部影像學與特發性間質性肺病都極其相似,需要進行相應的組織病理學檢查加以鑒別。還要和某些藥物性間質性肺纖維化相鑒別,后者停藥以后纖維化即可以停止發展。